Contrarrestar futuras pandemias mediante el análisis de datos de genomas de virus recombinantes. Un estudio publicado en la revista Comunicaciones de la naturaleza presenta los prometedores resultados de RecombinHunt, un nuevo método basado en datos desarrollado por el Departamento de Electrónica, Información y Bioingeniería de Politécnico de Milán y deUniversidad de Miláncapaz de reconocer, con gran precisión y eficiencia computacional, genomas recombinantes del SARS-CoV-2 con uno o dos puntos de ruptura.
La recombinación, la composición de dos o más genomas virales para formar un nuevo genoma, es un mecanismo molecular eficiente para la evolución y adaptación de los virus.
Impulsado por la pandemia de COVID-19, se han propuesto varios métodos para detectar genomas recombinantes del virus SARS-CoV-2; sin embargo, hasta ahora nadie ha podido confirmar fielmente los análisis manuales de los expertos del sector.
ReconbinHunt muestra una alta especificidad y sensibilidad, es más eficaz que todos los demás métodos ya desarrollados y confirma fielmente los análisis manuales de los expertos.
El método, desarrollado en el contexto del proyecto PRIN PNRR 2022 SENSITIVO (Sistema de alerta temprana de datos pequeños para patógenos virales en salud pública), Además también identifica genomas virales recombinantes de la reciente epidemia de viruela simica con una alta concordancia con los análisis realizados manualmente por los expertos, lo que sugiere que el enfoque es sólido y puede aplicarse a cualquier epidemia o virus pandémico, constituyendo una herramienta importante para combatir futuras pandemias.
El profesor Stefano Ceri señala que “La investigación fue posible gracias al extraordinario aporte de laboratorios de todo el mundo, que pusieron a disposición de la comunidad internacional más de 15 millones de secuencias virales..” el doctor Anna Bernasconiresponsable del proyecto SENSIBLE, observa: “YoNuestro objetivo es construir herramientas de alerta para anticipar y combatir nuevas epidemias y pandemias virales.“.
“El estudio demuestra cómo el desarrollo de métodos computacionales innovadores y eficientes nos permite apreciar de manera más precisa y rigurosa la evolución de los patógenos y sus implicaciones para la salud humana.“, él añade Mateo Chiaraprofesor de Biología Molecular en la Universidad Estatal de Milán y co-responsable del proyecto SENSIBLE.
Contribuyó al estudio. Tomasso Alfonsiquien recientemente obtuvo un doctorado “cum laude” en Ingeniería de la Información, presentando esta y otras investigaciones.
El enlace al estudio publicado en Nature Communications.
